1992年，中央首次明确了14所“副部级大学”，其党委书记、校长为中管干部，由中共中央、组织部联合任命，享受副部级待遇。
这14所高校北京占8所，分别是：北京大学、清华大学、中国人民大学、北京师范大学、北京理工大学、北京航空航天大学、中国农业大学、北京医科大学(2000年4月3日，与北京大学正式合并）。上海、陕西各占2所，分别是复旦大学、上海交通大学、西安交通大学、西北工业大学。安徽、黑龙江各占1所，分别是中国科学技术大学、哈尔滨工业大学。
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让人颇感意外的是，C9高校成员浙江大学、南京大学未入选，此外，武汉大学、华中科技大学等“网红”高校也都铩羽而归。那么，她们为什么会在这次至关重要的评选中败北呢？
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一、浙江大学
2019软科中国最好大学排名中，浙江大学位居全国第3，2019武书连中国大学排名100强中，浙江大学高居全国第2，仅次于清华大学。如果说两大排行榜的信服力还不足够的话，在2017年教育部第四次学科评估中，浙江大学斩获了11个A+专业、11个A级专业、17个A-专业！是毫无争议的全国第三。
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那么，如果“强悍”的浙江大学为什么会在1992年副部级大学评比中落选呢？其实这与浙江大学的历史有关。
1952年全国高等学校院系调整时，浙江大学部分系科转入兄弟高校和中国科学院，留在杭州的主体部分被分为多所单科性院校，后分别发展为原浙江大学、杭州大学、浙江农业大学和浙江医科大学。1998年，同根同源的四校实现合并，组建了新浙江大学，迈上了创建世界一流大学的新征程。也就是说，1992年的“浙江大学”并非我们现在所熟知的浙江大学！她的实力仅为新浙江大学的四分之一，所以说她的落选实属正常。
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二、南京大学
南京大学起源于中国大学的一所“航空母校”国立中央大学，其前身无比“强悍”，在1948年美国普林斯顿大学的世界大学排行榜中，国立中央大学曾位居亚洲第1、世界第9！
不过1952年全国高校院系调整，南京大学仅保留了原国立中央大学文、理学院，调整出了工学、农学、师范、水利学院等院系组建成了东南大学、南京农业大学、南京师范大学、河海大学等985、211高校，自此“元气大伤”。直至今日，南京大学都未完全从当年的院系调整中走出，1987年才创建医学院，师范学院、农学院至今未恢复。
所以南京大学未入选首批副部级高校也在情理之中。
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三、武汉大学、华中科技大学、中南大学、四川大学等后进副部级大学
在2000年大学合并潮中，华中科技大学、中南大学、四川大学绝对是最大的受益者之一。她们分别合并了中国五大医学院中的同济医学院、湘雅医学院、华西医学院，自此实力大进，排名一路上升。
而在合并之前，不少后进副部级高校都严重“偏科”，例如华中科技大学前身是华中工学院，中南大学前身是中南工业大学。所以，她们未入选首批副部级大学其实是理由当然。
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