根据《方案》，南开大学每年在国家拨款的基础上增投自筹经费1亿余元，用于研究生各项奖助政策支出。为了激励研究生潜心学术、竞攀科研高峰，《方案》提出，在校的顶尖博士研究生每年可累计获得各类奖助金额将超过10万元，顶尖硕士研究生每年可累计获得各类奖助金额将超过6万元。
在调整结构、优化体系的基础上，南开大学还将大幅提高奖优覆盖面，可获奖学金奖励的在校研究生比例较原政策提高5至8倍，让研究生在校学习、科研更有方向感、获得感。研究生的基本生活保障也将得到大幅提高：博士研究生助学金涨幅达42%，硕士研究生助学金涨幅达20%。值得关注的是，为响应我国研究生教育结构调整的趋势，研究生奖助新政将全日制专业学位硕士研究生的奖助水平提高至与学术学位硕士研究生保持一致。同时，为进一步吸引优秀生源，学校改革推免生奖学金方案，追加预算投入，从2020级起，推免生中的优秀生源在入学后即可获得最高6万元的综合奖励资助。
