南京大学软件学院是国家计委和教育部2002年批准设立的国家级示范性软件学院。学院全日制学生的教学区地处学校浦口校区对面的国家级南京高新技术产业开发区,学生食宿在学校浦口校区。学院在职软件工程硕士(MSE)教学中心设在学校鼓楼校区。现有在校本科生760余人研究生250余人。南京大学软件学院是我国高层次、复合型软件实用人才的重要培养基地,学院依托南京大学计算机软件新技术国家重点实验室和计算机软件与理论国家重点学科在科学研究上的优势,依托南京高新区在资金、政策和产业上的优势,积极进行软件工程技术项目研发和软件工程教育,为促进我国软件产业发展培养具有国际竞争能力的高级应用型软件人才。软件学院现设有软件工程系、信息系统工程系、嵌入式技术系等三个系,开设软件工程本科专业,软件工程领域工程硕士专业,应用软件工程硕士专业,系统分析与集成硕士专业,应用软件工程博士专业。同时还设有(教育部/科技部)国家级Linux技术培训与推广中心、Cisco网络技术学院、IBM Linux人才培养中心、国家软件人才国际培训(南京)基地。学院形成了面向软件生产、面向软件服务等两类应用型软件人才的培养体系,开展系统分析与软件设计、软件过程与管理、数据库与信息系统工程、网络通信与多媒体技术、嵌入式软件技术等专门化方向的人才培养工作。